技術領域
[0001] 本
發(fā)明涉及殺蟲劑抗藥性檢測技術領域,具體涉及一種基于環(huán)介導恒溫擴增技術快速檢測桃蚜對擬
除蟲菊酯類殺蟲劑抗藥性的方法。
背景技術
[0002] 農林
有害生物會嚴重危害農業(yè)和林業(yè)的發(fā)展,目前已報道的農林
有害生物種類繁多,其中,蝗蟲、桃蚜、草地貪夜蛾、小麥赤霉病、稻瘟病等均會對
植物造成嚴重危害。目前,
化學防治仍在有害
生物防治中發(fā)揮主要作用,但是,化學
農藥的不合理使用,如對單一藥劑品種的長期依賴和過量、頻繁使用,使有害生物抗性頻發(fā),藥劑防治效果下降。目前,至少有30種
農作物害蟲對40種殺蟲劑產(chǎn)生不同程度的抗性。病蟲害抗藥性的產(chǎn)生往往會導致
病蟲害防治難度加大,易造成病蟲害的再猖獗。同時,病蟲害的抗藥性迫使投入更多的
化學農藥,不僅易對環(huán)境造成多種污染,而且會殺傷多種非靶標生物。農藥殘留已經(jīng)成為農產(chǎn)品
質量的主要威脅。
[0003] 桃蚜是重要的多食性經(jīng)濟害蟲,具有生活周期短、世代重疊嚴重、繁殖快、后代存活率高等特點,導致桃蚜的危害性十分嚴重。桃蚜危害到50個科的400多種植物,主要有十字花科的油菜、甘藍、辣椒、白菜、薺菜等,薔薇科的桃樹、杏樹、李樹等,茄科的
馬鈴薯、
煙草、番茄等,豆科的大巢菜、紫
云英等。桃蚜以成蟲和若蟲的形態(tài)聚集在葉背面以及嫩莖、嫩梢上,刺吸大量的汁液,造成植物
葉片卷縮
變形、發(fā)黃、失
水,使得植物營養(yǎng)缺失、發(fā)育不良、生長緩慢。除此以外,桃蚜分泌的蜜露還會引發(fā)
煤污病,影響作物的質量。同時桃蚜作為植物病毒傳播的媒介,可傳播100多種植物病毒,如黃瓜花葉病毒、西瓜花葉病毒、煙草花葉病毒等,直接影響到了經(jīng)濟作物的正常生長,造成大量減產(chǎn)。
[0004] 擬除蟲菊酯類殺蟲劑包括高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、氰戊菊酯、氯氰菊酯和聯(lián)苯菊酯等,對于桃蚜具有較好的殺滅作用,但是桃蚜會迅速產(chǎn)生抗藥性。導致害蟲抗藥性的一個主要形式是
擊倒抗性。擊倒抗性最早被用來描述
家蠅沒有被DDT擊倒并存活下來的現(xiàn)象,并且還與擬除蟲菊酯類殺蟲劑存在交互抗性。到目前為止幾乎所用的農業(yè)、衛(wèi)生害蟲中都存在擊倒抗性。對擊倒抗性的研究表明,這種抗性主要是由Na+通道特定
位置的
氨基酸突變所致。Williamson等最早通過遺傳分子標記的方法將家蠅擊倒抗性基因
定位于Na+通道,通過測序發(fā)現(xiàn)位于家蠅Na+通道基因ⅡS6上的第1014位亮氨酸到苯丙氨酸的突變(L1014F)是擊倒抗性產(chǎn)生的原因。殺蟲劑靶標突變是害蟲對殺蟲劑產(chǎn)生抗性的主要原因之一,如與有機磷殺蟲劑、氨基
甲酸酯類殺蟲劑相關的乙酰膽
堿酯酶突變、與新煙堿類殺蟲劑相關的乙酰膽堿受體突變。這些突變多為單堿基突變,因此可以利用單核苷酸多態(tài)性(single?nucleotide?polymorphism,SNP)檢測技術確定抗性相關突變位點是否存在。
[0005] 環(huán)介導等溫擴增技術(loop-mediated?isothermal?amplification,LAMP)是利用具有很強的鏈置換能
力的Bst?DNA?Polymerase,識別針對目標序列六個特定區(qū)域設計的兩對引物在等溫條件下實現(xiàn)擴增反應。兩對引物包括:外引物F3和B3,內引物FIP(forward?inner?primer)和BIP(backward?inner?primer)。LAMP反應首先在一對外引物的作用下擴增出內引物結合的
片段,緊接著在一對內引物的作用下合成目的序列,由于內引物擴增的DNA產(chǎn)物包含與該引物5’端反向互補的序列,所以擴增產(chǎn)物內部會形成莖環(huán)結構。Bst?DNA?Polymerase將該產(chǎn)物置換下來之后,在另外一條內引物的作用下在DNA片段的另外一端產(chǎn)生了新的莖環(huán)結構,形成
啞鈴結構,如此往復循環(huán)。由于內引物發(fā)生反應的起始時間不同,所以最終會形成大小不一的DNA片段,在瓊脂糖凝膠
電泳中可以觀察到連續(xù)的條帶。在擴增反應中大量的焦
磷酸根離子被解離下來,與反應體系中的鎂離子結合,形成焦磷酸鎂白色沉淀,使反應體系變得渾濁,可用肉眼觀察到沉淀的有無來判斷LAMP反應是否發(fā)生。LAMP技術在恒溫的條件下在60min內就可以實現(xiàn)目的片段的大量擴增,具有反應迅速、靈敏性高、特異性強、對設備要求低、結果易于觀察等優(yōu)點,非常適合昆蟲基因突變情況在田間的快速檢測。中國
專利CN201510204854.6建立了一種多菌靈抗性基因型F200Y核盤菌的LAMP檢測技術。目前對于桃蚜的抗藥性的檢測方法存在靈敏度低、周期長、材料要求高、人力要求高等問題,尚沒有關于桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性的快速高效的檢測方法。
發(fā)明內容
[0006] 為解決
現(xiàn)有技術中存在的技術問題,本發(fā)明的目的在于提供一種LAMP快速高效檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗藥性的方法。
[0007] 為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明經(jīng)過多年的田間采集和室內選育獲得了桃蚜對高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、氰戊菊酯、氯氰菊酯和聯(lián)苯菊酯的敏感品系和抗性品系,并發(fā)現(xiàn)桃蚜的抗性品系的
電壓門控Na+通道(Sodium?Channel)存在抗性相關突變L1014F。電壓門控Na+通道的L1014F突變主要導致對DDT和擬除蟲菊酯類殺蟲劑的抗性。本發(fā)明通過針對桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性的靶標變異——電壓門控Na+通道L1014F突變設計2對LAMP特異性擴增引物,利用該LAMP引物組進行LAMP擴增反應,檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑的抗性。
[0008] 具體地,本發(fā)明的技術方案如下:
[0009] 第一方面,本發(fā)明提供用于檢測桃蚜電壓門控Na+通道突變的LAMP引物組,包含外引物對和內引物對,其中,外引物對的序列如SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2所示,內引物對的序列如SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.4所示。
[0010] 外引物F3:CAAAGACCACGAGCTTCC;
[0011] 外引物B3:CCGAGTAGTACATATTTATCATTCA;
[0012] 內引物FIP:GTCCCACATTGATTCTATCCATTCGAACTTCACCGATTTTTTGCA;
[0013] 內引物BIP:CTGTTTACACGTCGGAGAACCAAAGTACTTATACATACCACGAA。
[0014] 本發(fā)明所述的電壓門控Na+通道突變具體為第1014位亮氨酸突變?yōu)楸奖彼?L1014F)。
[0015] 上述引物組所針對的電壓門控Na+通道L1014F突變片段序列如SEQ?ID?NO.5所示,其中,Y代表C/T(該位點突變前為C,突變后為T),對應L1014F突變。
[0016] 本發(fā)明中,擬除蟲菊酯類殺蟲劑包括但不限于高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、氰戊菊酯、氯氰菊酯和聯(lián)苯菊酯。
[0017] 第二方面,本發(fā)明提供所述LAMP引物組在制備用于桃蚜抗藥性檢測
試劑盒中的應用。
[0018] 第三方面,本發(fā)明提供包含所述LAMP引物組的試劑盒。
[0019] 所述試劑盒還可包含選自反應緩沖液、鏈置換DNA聚合酶,dNTPs、MgSO4、丙三醇、二甲基亞砜中的一種或多種。上述試劑可以共同組成LAMP反應液,所述LAMP反應液可與所述LAMP引物組組成LAMP擴增反應的反應體系。
[0020] 第四方面,本發(fā)明提供所述LAMP引物組或包含所述LAMP引物組的試劑盒在檢測桃蚜電壓門控Na+通道突變中的應用。
[0021] 所述電壓門控Na+通道突變具體為L1014F突變。
[0022] 第五方面,本發(fā)明提供所述LAMP引物組或包含所述LAMP引物組的試劑盒在檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗藥性中的應用。
[0023] 第六方面,本發(fā)明提供一種檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗藥性的方法,包括:利用所述LAMP引物組或包含所述LAMP引物組的試劑盒進行LAMP擴增反應。
[0024] 優(yōu)選地,所述LAMP擴增反應的反應程序包括:60-64℃反應40-50min,85℃反應3~6min。
[0025] 優(yōu)選地,所述LAMP擴增反應的反應體系包括終濃度為1~3μM的外引物對和終濃度為12~20μM的內引物對。
[0026] 更優(yōu)選地,所述反應體系還包括1~3%二甲基亞砜
[0027] 作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述LAMP擴增反應的25μL反應體系包括:2.5μL?10×反應緩沖液、8U鏈置換DNA聚合酶,1μL單頭待測桃蚜基因組DNA、終濃度1.4mM的dNTPs、終濃度4mM的MgSO4、終濃度2μM的外引物對、終濃度16μM的內引物對、1.5μL的丙三醇、0.25μL的二甲基亞砜。
[0028] 上述反應體系可加水補足至25μL。
[0029] 優(yōu)選地,所述檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗藥性的方法中,根據(jù)LAMP擴增反應的
顏色變化或根據(jù)擴增產(chǎn)物的電泳檢測條帶判斷待測桃蚜是否存在電壓門控Na+通道突變。
[0030] 作為本發(fā)明的一種實施方式,在LAMP擴增反應結束后加入核酸染料SYBR?Green?I進行反應,若反應顏色為
熒光綠色,則待測桃蚜為抗性突變個體;若反應顏色為淺褐色,則待測桃蚜為敏感未突變個體。
[0031] 本發(fā)明的有益效果在于:本發(fā)明發(fā)現(xiàn)擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性桃蚜存在電壓門控Na+通道的L1014F突變,針對該突變設計了高效特異的LAMP引物組,針對該引物組開發(fā)了LAMP檢測方法,實現(xiàn)了桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性的快速高效檢測,對于抗性害蟲的準確檢測、抗性群體發(fā)展動態(tài)的信息獲得以及指導科學用藥、降低成本和減少環(huán)境污染具有重要意義。與傳統(tǒng)的桃蚜抗藥性檢測方法相比,本發(fā)明提供的檢測方法具有以下優(yōu)勢:
[0032] 1、特異性高、可重復性高:本發(fā)明提供的LAMP引物組具有高度的特異性,可特異檢+測電壓門控Na 通道L1014F突變,對于未突變的野生型則無法擴增,同時具有高度的可重復性。
[0033] 2、準確性高:本發(fā)明的LAMP檢測方法具有較高的準確性,判斷為陽性檢測結果的樣品與電壓門控Na+通道L1014F突變的符合率高。
[0034] 3、靈敏度高:本發(fā)明提供的LAMP檢測方法的靈敏度高,擴增模板所需量少,最少只需要10個拷貝數(shù)的模板就可以在短時間內擴增109-1010倍,比傳統(tǒng)的PCR擴增技術高100-1000倍。
[0035] 4、
假陽性率低:本發(fā)明通過LAMP引物組的特異設計并配合在LAMP反應體系中加入二甲基亞砜有效降低了假陽性的產(chǎn)生。
[0036] 5、檢測周期短:本發(fā)明的LAMP檢測方法在60分鐘內即可完成檢測,極大地縮短了桃蚜抗藥性檢測的周期,提高了檢測的工作效率。
[0037] 6、簡單易行:本發(fā)明的LAMP檢測方法只需在恒溫下進行,水浴、金屬浴加熱即可完成檢測,不需要昂貴的儀器設備,且操作步驟簡單。
[0038] 7、結果易于鑒定:本發(fā)明的LAMP檢測方法可通過觀察是否有白色沉淀或者通過添加核酸染料SYBR?Green?I,觀察反應后的顏色變化,判斷反應是否進行,進而判斷桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑的抗藥性。
附圖說明
[0039] 圖1為本發(fā)明
實施例1中不同濃度二甲基亞砜對LAMP反應假陽性產(chǎn)生的影響分析結果;其中,M:DNA?marker,1-3為未添加二甲基亞砜,1:模板為水,2:模板為未突變質粒,3:模板為突變質粒;4-6為添加1%二甲基亞砜,4:模板為水,5:模板為未突變質粒,6:模板為突變質粒;7-9為添加2%二甲基亞砜,7:模板為水,8:模板為未突變質粒,9:模板為突變質粒;10-12為添加3%二甲基亞砜,10:模板為水,11:模板為未突變質粒,12:模板為突變質粒;13-15為添加4%二甲基亞砜,13:模板為水,14:模板為未突變質粒,15:模板為突變質粒。
[0040] 圖2為本發(fā)明實施例1中不同反應時間、
溫度的LAMP反應電泳圖;其中,A為不同反應時間的LAMP反應電泳圖,M:DNA?marker1-6依次是63℃反應25min、30min、35min、40min、45min和50min;B為不同反應溫度的LAMP反應電泳圖,M:DNA?marke,1-7依次是56℃、58℃、
60℃、62℃、64℃、66℃和68℃反應40min。
[0041] 圖3為本發(fā)明實施例2中LAMP檢測方法的特異性及重復性分析;其中,A為LAMP檢測L1014F突變的核酸染料SYBR?Green?I顯色變化圖;B為LAMP檢測L1014F突變的瓊脂糖凝膠電泳圖;M:DNAmarker;1-3:模板為ddH2O;4-6:模板為野生型桃蚜DNA;7-9:模板為含L1014F突變的質粒。
[0042] 圖4為本發(fā)明實施例3中LAMP產(chǎn)物酶切驗證電泳圖;其中,M:DNA?marker,1:含L1014F突變的質粒,2:LAMP產(chǎn)物經(jīng)HinfI酶切的產(chǎn)物。
具體實施方式
[0043] 下面將結合實施例對本發(fā)明的優(yōu)選實施方式進行詳細說明。需要理解的是以下實施例的給出僅是為了起到說明的目的,并不是用于對本發(fā)明的范圍進行限制。本領域的技術人員在不背離本發(fā)明的宗旨和精神的情況下,可以對本發(fā)明進行各種
修改和替換。
[0044] 下述實施例中所使用的實驗方法如無特殊說明,均為常規(guī)方法。
[0045] 下述實施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業(yè)途徑得到。
[0046] 實施例1?利用LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性的方法的建立
[0047] 1、LAMP引物組設計
[0048] 針對桃蚜電壓門控Na+通道L1014F突變,本發(fā)明經(jīng)過大量實驗篩選和優(yōu)化獲得了具有高度特異性、結合力和擴增效率的LAMP引物組,其由一對外引物和一對內引物組成,其中,一對外引物的序列如SEQ?ID?NO.1-2所示,一對內引物的序列如SEQ?ID?NO.3-4所示,L1014F突變位點位于反向內引物BIP的3’端。
[0049] 外引物F3:CAAAGACCACGAGCTTCC;
[0050] 外引物B3:CCGAGTAGTACATATTTATCATTCA;
[0051] 內引物FIP:GTCCCACATTGATTCTATCCATTCG-AACTTCACCGATTTTTTGCA;
[0052] 內引物BIP:CTGTTTACACGTCGGAGAACCAA-AGTACTTATACATACCACGAA。
[0053] 2、LAMP反應體系的確定
[0054] 本發(fā)明通過在LAMP反應體系中加入二甲基亞砜并優(yōu)化其濃度,有效降低了假陽性率,并確定了最佳的反應體系。
[0055] LAMP反應的25μL體系如下:2.5μL?10×Bst?Buffer、8U?Bst?2.0DNA?Polymerase,1μL擴增模板、終濃度1.4mM的dNTPs、終濃度4mM的MgSO4、終濃度2μM的外引物對、終濃度16μM的內引物對、1.5μL的丙三醇和二甲基亞砜,二甲基亞砜的加入量分別為0、0.25、0.5、0.75或1μL,加雙蒸水至反應總體積為25μL。
[0056] 每3個樣品為一組,其中1-3、4-6、7-9、10-12和13-15樣品的反應體系中二甲基亞砜的加入量分別為0、0.25、0.5、0.75和1μL,每組的3個樣品的擴增模板依次為水、未突變質粒和突變質粒。
[0057] 未突變質粒和突變質粒的構建方法如下:
[0058] (1)PCR擴增目的片段:采用基因組DNA提取試劑盒提取單頭無翅成蚜的基因組DNA,以L1014F雜合突變桃蚜的基因組DNA為模板,使用上游引物(kdr-S:5’-TATGCAGTTATTTGGAAA-3’)下游引物(kdr-A:5’-GTAGGTTCTGGATAGCAA-3’)對包含LAMP目的序列的DNA片段進行PCR擴增。PCR擴增反應體系(共25μL)如下:12.5μL?2×Phanta?Max?Master?Mix,1μL上游引物,1μL下游引物,1μL基因組DNA。PCR擴增反應程序如下:94℃預變性3min;35個循環(huán)(94℃變性30s,46℃
退火40s,72℃延伸40s);72℃徹底延伸7min。
[0059] (2)質粒構建:將PCR產(chǎn)物進行膠回收后,將目的產(chǎn)物連接到質粒pClone007Blunt?Simple?Vector。反應體系:1μL純化產(chǎn)物,1μLpClone007Blunt?Simple?Vector,10×Topo?Mix?1μL,ddH2O?7μL。在室溫(22-30℃)條件下反應1-5min。
[0060] (3)細菌轉化和提取質粒:取100μL
冰浴上融化的感受態(tài)細胞,加入連接產(chǎn)物輕輕混勻,冰上靜置25min;42℃水浴熱激30-45s,迅速轉移至冰浴中,靜置2min;向離心管中加入不含抗生素的無菌培養(yǎng)基,混勻后37℃、200rpm復蘇1h;吸取復蘇液均勻涂布到含抗生素的LB培養(yǎng)基上,將平板倒置,37℃
培養(yǎng)箱過夜培養(yǎng),提取質粒送公司進行測序。將測序正確的、包含L1014F突變的質粒(突變質粒)和不包含L1014F突變的質粒(未突變質粒)于-20℃保存,待用。
[0061] LAMP反應程序為:63℃反應40min,85℃反應5min。
[0062] 反應體系中加入不同濃度的二甲基亞砜的擴增結果分析:取5μLPCR擴增產(chǎn)物,在2.0%的瓊脂糖凝膠上進行電泳,紫外光下檢測,結果如圖1所示,1、4、7、10、13樣品無特異性條帶,以水為模板的對照組未發(fā)生假陽性擴增。2樣品有特異性條帶但不明顯,5、8、11、14樣品無特異性條帶,未加入二甲基亞砜的樣品發(fā)生假陽性擴增,而加入二甲基亞砜后,假陽性擴增被有效抑制。3、6、9、12樣品有特異性條帶,隨著二甲基亞砜濃度的升高條帶的
亮度逐漸降低。15樣品無特異性條帶,當二甲基亞砜的濃度達到4%時,LAMP反應被徹底抑制,不發(fā)生反應。以上結果表明,不添加二甲基亞砜時,LAMP體系會發(fā)生非特異性擴增,1-3%的二甲基亞砜添加可以有效抑制假陽性的產(chǎn)生,4%及以上的二甲基亞砜添加會徹底抑制LAMP反應的發(fā)生。因此,確定在反應體系中加入1-3%的二甲基亞砜抑制假陽性的產(chǎn)生。
[0063] 3、LAMP反應條件的確定
[0064] 采用上述2中確定的LAMP反應體系,進行LAMP反應條件的優(yōu)化,具體如下:
[0065] LAMP反應體系(25μL):2.5μL10×Bst?Buffer、8U?Bst?2.0DNAPolymerase,1μL突變質粒、終濃度1.4mM的dNTPs、終濃度4mM的MgSO4、終濃度2μM的外引物、終濃度16μM的內引物、1.5μL的丙三醇、0.25μL的二甲基亞砜,加雙蒸水至反應總體積為25μL。
[0066] LAMP反應程序:
[0067] 反應時間的確定:分別在63℃反應25min、30min、35min、40min、45min和50min(上述反應時間對應的樣品依次命名為樣品1-6),85℃反應5min。
[0068] 反應溫度的確定:分別在56℃、58℃、60℃、62℃、64℃、66℃和68℃(上述反應溫度對應的樣品依次命名為樣品1-7)反應40min,85℃反應5min。
[0069] 結果分析:取5μL?PCR擴增產(chǎn)物,在2.0%的瓊脂糖凝膠上進行電泳,紫外光下檢測,結果如圖2所示。圖2的A顯示,1-3樣品無特異性條帶或者特異性條帶不明顯,4-6樣品特異性條帶明顯,并且特異性條帶的亮度隨著反應時間的增加而增加。隨著反應時間的增加,LAMP反應產(chǎn)物逐漸增多。結果表明,在LAMP反應發(fā)生40-50min后,可以產(chǎn)生大量的反應產(chǎn)物。圖2的B顯示,1、2、6和7樣品無特性條帶或者特異性條帶不明顯,3-5樣品特異性條帶明顯。隨著溫度的升高LAMP反應開始進行,溫度進一步升高又會抑制LAMP反應。結果表明,當溫度在60℃-64℃時,LAMP反應可以有效的進行。
[0070] 綜合以上結果,確定利用LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性的方法具體如下:采用序列如SEQ?ID?NO.1-4的引物組進行LAMP反應;LAMP反應體系(25μL)為:2.5μL10×Bst?Buffer、8U?Bst2.0DNA?Polymerase,1μL突變質粒、終濃度1.4mM的dNTPs、終濃度4mM的MgSO4、終濃度2μM的外引物、終濃度16μM的內引物、1.5μL的丙三醇、0.25μL的二甲基亞砜,加雙蒸水至反應總體積為25μL。LAMP反應程序為:60-64℃反應40-50min,85℃反應3~6min。
[0071] 實施例2?LAMP檢測方法的特異性及重復性分析
[0072] 為驗證實施例1提供LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性方法的特異性,分別以含L1014F突變質粒(陽性對照)、野生型桃蚜基因組DNA、雙蒸水(陰性對照)為模板,進行LAMP反應,每個模板設置三個重復。
[0073] LAMP反應體(25μL)系:2.5μL?10×Bst?Buffer、8U?Bst?2.0DNAPolymerase,1μL擴增模板、終濃度1.4mM的dNTPs、終濃度4mM的MgSO4、終濃度2μM的外引物、終濃度16μM的內引物、1.5μL的丙三醇、0.25μL的二甲基亞砜,加雙蒸水至反應總體積為25μL。
[0074] LAMP反應程序:63℃反應40min,85℃反應5min。
[0075] LAMP反應結束后在反應體系中加入SYBR?Green?I進行顯色反應。
[0076] 結果分析:根據(jù)反應體系顏色作為結果判斷標準,結果如圖3的A所示,以雙蒸水(陰性對照)為模板的樣品1-3呈現(xiàn)黃褐色;以野生型桃蚜個體(敏感個體)基因組DNA為模板的樣品4-6呈現(xiàn)黃褐色;以含L1014F突變質粒為模板的樣品7-9呈現(xiàn)熒光綠。
[0077] 為了進一步驗證上述顏色變化判斷結果的準確性,取5μL?PCR擴增產(chǎn)物,在2.0%的瓊脂糖凝膠上進行電泳,紫外光下檢測,結果如圖3的B所示,以雙蒸水(陰性對照)和野生型桃蚜個體(敏感個體)基因組DNA為模板的樣品1-6樣品均無條帶,以含L1014F突變質粒為模板的樣品7-9呈現(xiàn)一系列不同大小的DNA片段,電泳結果與顏色檢測結果一致。以上結果說明,實施例1提供LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性方法具有較高的特異性。
[0078] 實施例3?LAMP檢測方法的準確性分析
[0079] 對實施例1提供LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性方法的準確性進行分析,具體如下:
[0080] 在實施例1提供的LAMP的內引物(SEQ?ID?NO.3-4)擴增區(qū)域上鑒定有HinfI限制性核酸內切酶酶切位點,因此,通過在LAMP反應結束后,用HinfI酶酶切LAMP產(chǎn)物,分析LAMP檢測的準確性。
[0081] HinfI酶酶切反應體系:2.5μL?10×NEBuffer,10U?HinfI,10μLLAMP反應產(chǎn)物,加雙蒸水至反應總體積為25μL。
[0082] 反應程序:37℃反應40min,80℃反應10min。
[0083] 結果分析:將酶切產(chǎn)物進行電泳檢測,結果如圖4所示。由于LAMP反應產(chǎn)物是由一系列重復的目標序列連接而成,使用HinfI限制性核酸內切酶降解后可得到160bp左右大小的DNA片段,表明實施例1提供LAMP檢測桃蚜對擬除蟲菊酯類殺蟲劑抗性方法具有較高的準確性。
[0084] 雖然,上文中已經(jīng)用一般性說明、具體實施方式及試驗,對本發(fā)明作了詳盡的描述,但在本發(fā)明
基礎上,可以對之作一些修改或改進,這對本領域技術人員而言是顯而易見的。因此,在不偏離本發(fā)明精神的基礎上所做的這些修改或改進,均屬于本發(fā)明要求保護的范圍。