知識產(chǎn)權(quán)熱潮涌動下，農(nóng)業(yè)領(lǐng)域知識產(chǎn)權(quán)也不斷出現(xiàn)新專利新發(fā)明，所以在知識產(chǎn)權(quán)交易市場中，很有必要對農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)交易進行保護。受產(chǎn)業(yè)特征的影響，農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)除具有排他性、地域性、時間性等知識產(chǎn)權(quán)的一般特征外，還具有易擴散性、權(quán)利主體的難以控制性、產(chǎn)權(quán)價值標準的不確定性等特征。保護農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)交易，主要在于對農(nóng)業(yè)專利類的保護。

一、加大宣傳培訓力度。要利用報告會、培訓班以及專題講座等形式，舉辦一系列形式多樣的知識產(chǎn)權(quán)宣傳和教育活動，讓知識產(chǎn)權(quán)保護早日轉(zhuǎn)變成為廣大農(nóng)民群眾和農(nóng)業(yè)企業(yè)的自覺行動。要不斷提高廣大干部群眾的知識產(chǎn)權(quán)保護意識，特別是商標意識和品牌意識不斷增強知識產(chǎn)權(quán)在新農(nóng)村建設(shè)中的影響力和覆蓋面。同時，更要加強宣傳，動員全社會都來關(guān)心和支持農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護工作。因而在知識產(chǎn)權(quán)的交易過程中，提高警惕心理。
二、完善基層知識產(chǎn)權(quán)管理體系。加快建立健全社會化、網(wǎng)絡(luò)化的知識產(chǎn)權(quán)管理和服務(wù)體系。把知識產(chǎn)權(quán)管理機制向縣級延伸，努力形成多層次、協(xié)調(diào)運作的知識產(chǎn)權(quán)管理機制，逐步建立專利管理工作評價體系，穩(wěn)定專利管理工作隊伍，更好地發(fā)揮政府職能部門的作用，注重從政策措施、工作機制、管理模式、服務(wù)手段等方面開拓創(chuàng)新，不斷提高知識產(chǎn)權(quán)事務(wù)的管理能力和服務(wù)水平。
三、加強企業(yè)創(chuàng)新能力的培養(yǎng)。技術(shù)創(chuàng)新實質(zhì)上是一個起始于科學研究與市場需求交互作用中的創(chuàng)新構(gòu)思，通過新產(chǎn)品的設(shè)計、試制、生產(chǎn)而止于市場銷售的系列活動過程，是一個技術(shù)的創(chuàng)造、轉(zhuǎn)換、應用和實現(xiàn)的復雜過程。當前，必須加強企業(yè)創(chuàng)新能力的培養(yǎng)，不斷擴大企業(yè)專利、商標等自主知識產(chǎn)權(quán)的擁有量，努力提升企業(yè)的核心競爭能力，培育一批具有較強國內(nèi)影響力的知名品牌。
四、進一步加強農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)交易的立法工作。建立統(tǒng)一完善的農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)法律體系，能夠使公眾更全面、準確地了解自己和他人權(quán)利的范圍及救濟手段，避免法律規(guī)范之間的交叉沖突，是農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護工作的基礎(chǔ)和依據(jù)。在完善的農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)法律體系中應包括動、植物進出境檢疫法及其配套法規(guī)，農(nóng)產(chǎn)品、食品和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料的進口技術(shù)標準，與地理標志和民間工藝等相關(guān)的規(guī)定，對動、植物新品種及新組合的保護，以及根據(jù)我國實際的承受能力，逐步放開的對農(nóng)業(yè)生物技術(shù)中轉(zhuǎn)基因技術(shù)、基因克隆技術(shù)等的保護等。此外，在加強立法工作的同時，還要加強對農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)有關(guān)法律知識的宣傳、學習、教育工作，以努力提高國民的法律意識和遵守知識產(chǎn)權(quán)法的自覺性。
五、疏通投融資渠道，為成果轉(zhuǎn)化提供良好的經(jīng)費保障。各級政府應加大力度，疏通融資渠道，盡快建立、健全貸款擔保機構(gòu)和擔?；?，中小企業(yè)發(fā)展基金和風險投資基金等，從根本上解決縣域中小企業(yè)擔保難問題，確保中小企業(yè)在日常生產(chǎn)活動的資金需求。各級金融機構(gòu)要加強對中小企業(yè)的信貸支持力度，政府財政部門也應了解實際情況，有針對性的扶植一批有一定規(guī)模和影響力的農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化龍頭企業(yè)，從而“以點帶面”起到示范、輻射和帶動作用。
六、完善農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)司法保護中的各項制度。司法保護是知識產(chǎn)權(quán)保護的中心和關(guān)鍵環(huán)節(jié)，是最重要的知識產(chǎn)權(quán)法律實施活動。加入世貿(mào)組織以來，隨著一些領(lǐng)域的過渡寬限已經(jīng)逐漸到期，處于弱勢地位的中國農(nóng)業(yè)將受到嚴峻挑戰(zhàn)，因而加強農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護，除了要建立完善的法制體系外，還要建立高水平的司法體系。具體而言，一是要建立健全農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)案件審判組織。由于審理農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)案件要求的專業(yè)性強、技術(shù)含量高，各省、直轄市、自治區(qū)的高級人民法院和中級人民法院，要根據(jù)需要設(shè)立農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)審判庭或在有關(guān)審判庭里設(shè)立專門審理知識產(chǎn)權(quán)案件的合議庭，以保證執(zhí)法的統(tǒng)一性，并積累經(jīng)驗、提高知識產(chǎn)權(quán)案件的司法水平；二是要完善各項責任制度。即對于侵犯他人知識產(chǎn)權(quán)情節(jié)嚴重、構(gòu)成犯罪的，可以依法追究其刑事責任，對公民、法人和其他組織因不服知識產(chǎn)權(quán)行政管理機關(guān)處理的知識產(chǎn)權(quán)糾紛決定提起的行政訴訟，人民法院有責任依據(jù)行政訴訟法進行審理，并依法做出維持、撤銷或變更行政決定的判決。
七、加強政府監(jiān)管，增強執(zhí)法力度，保護產(chǎn)權(quán)所有人的合法權(quán)益。切實有效地保護農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)是實行農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護制度成功與否的關(guān)鍵所在，因而加強執(zhí)法部門的執(zhí)法水平和執(zhí)法力度至關(guān)重要。除了人民法院外，知識產(chǎn)權(quán)行政執(zhí)法是查處違法和保護產(chǎn)權(quán)的重要力量，要求有關(guān)部門提高執(zhí)法人員素質(zhì)，嚴格執(zhí)法，同時強化農(nóng)工商、公檢法、技術(shù)監(jiān)督等部門聯(lián)合執(zhí)法，與人民法院密切配合，共同營造有利于農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護的法制環(huán)境，確保農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)的有效保護。
八、強化權(quán)利人自我救濟意識。自我救濟包括知識產(chǎn)權(quán)集體管理組織保護與知識產(chǎn)權(quán)人或其他利害關(guān)系人的自我保護兩種。集體管理組織是對知識產(chǎn)權(quán)創(chuàng)造者或其他權(quán)利人自身權(quán)利予以保護的社會組織。發(fā)達國家的公司、企業(yè)等都十分重視自身知識產(chǎn)權(quán)的保護，設(shè)有專門從事知識產(chǎn)權(quán)法律事物的部門，我國各級農(nóng)業(yè)行政管理部門、科研教學單位、企業(yè)、農(nóng)民要自覺學習農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護及相關(guān)法律知識，深入了解申請專利、植物新品種保護、商標以及著作權(quán)的條件、程序等，樹立知識產(chǎn)權(quán)觀念，提高維權(quán)意識和能力，積極依法取得自主知識產(chǎn)權(quán)，提高農(nóng)業(yè)知識產(chǎn)權(quán)申請的數(shù)量和質(zhì)量。
九、建立健全農(nóng)業(yè)科研院校以及涉農(nóng)企業(yè)知識產(chǎn)權(quán)保護管理機構(gòu)。農(nóng)業(yè)高等院校、科研單位及涉農(nóng)企業(yè)應健全知識產(chǎn)權(quán)保護組織機構(gòu)，建立健全內(nèi)部知識產(chǎn)權(quán)管理機構(gòu)，對本單位的知識產(chǎn)權(quán)保護工作進行統(tǒng)一管理，協(xié)調(diào)處理單位內(nèi)外的知識產(chǎn)權(quán)糾紛和矛盾，將知識產(chǎn)權(quán)保護工作貫穿于科研工作的全過程。具體而言，在科研課題選題和立項時，要進行查新檢索，特別是專利文獻檢索，力求項目的新穎性、創(chuàng)造性和實用性，避免低水平的重復研究，侵犯他人知識產(chǎn)權(quán)；在科研項目完成后，要先實施知識產(chǎn)權(quán)保護后再發(fā)表論文論著、成果鑒定和參加交流、申報獎勵。 其次，完善農(nóng)業(yè)科技成果知識產(chǎn)權(quán)激勵機制。要逐步完善農(nóng)業(yè)科技專利的利益分配機制，在借鑒國外成功經(jīng)驗的基礎(chǔ)上，采取物質(zhì)刺激與精神獎勵相結(jié)合的激勵方式，建立起政府激勵、市場激勵與單位激勵相結(jié)合的多元激勵機制；要改革農(nóng)業(yè)科技評價機制，將農(nóng)業(yè)專利等知識產(chǎn)權(quán)作為農(nóng)業(yè)科技成果評價的重要指標，與科技人員職稱晉級、利益分配等方面掛鉤，同時認真貫徹實施獎酬機制，使產(chǎn)權(quán)人真正得到應有的回報，充分調(diào)動廣大農(nóng)業(yè)科技工作者的積極性。